يحتوى معهد البحوث الطبية على 21 قسم :
- الكيمياء الحيوية
- الكيمياء الطبية التطبيقية
- الفسيولوجى
- الفارماكولوجى
- أمراض الدم
- الميكروبيولوجى
- الطفيليات
- المناعة و الحساسية
- كيمياء و بيولوجيا الخلايا
- الباثولوجى
- الأشعة التشخيصية
- علوم الإشعاع
- علاج وأبحاث الاورام
- الفيزياء الحيوية
- المعلوماتية الحيوية و الإحصاء الطبى
- الهندسة الحيوية الطبية
- الوراثة الإنسانية
- الجراحه التجريبية والاكلينيكية
- الأمراض الباطنة
- التخدير
- الباثولوجيا الكيميائية